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教育部学术论文免费快速发布平台，中国预印本先行者

Stanford年度跨学科生物计算研讨会，1月夏威夷举行

计算生物学顶级学术会议，侧重算法与计算方法创新

UIUC分子动力学可视化和分析软件，含Tachyon光线追踪渲染

RCSB PDB/PDBe联合开发的大分子3D查看器，WebGL高性能渲染

全球最具影响力的生物技术行业媒体，1981年创刊

专注CRISPR基因编辑的同行评审学术期刊

GA4GH工作流与工具共享平台

MIT OpenCourseWare Biology

科普与公众科学

MIT生物学免费完整课程资料

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R基因组数据与Hi-C可视化包

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全染色体基因组数据可视化R包

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R基因组多轨道出版级可视化

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出版级差异表达火山图R包

VCF/BCF变异格式规范文档

瑞典SciLifeLab国家生命科学数据共享平台

Monash RNA-seq一键自动化分析流程

NCBI GEO数据差异表达在线分析工具

NHGRI基因组学安全云分析平台AnVIL

EMBL-EBI新物种基因组注释快速发布平台

EMBL-EBI全球最大质谱蛋白质组学数据存储库

贝叶斯多组学因子分析整合降维工具

Bioconductor贝叶斯单细胞双聚类分析包

Bioconductor RNA-seq一键自动化分析报告生成包

Bioconductor基于ggplot2的系统发育树可视化包

Bioconductor系统发育树多格式I/O与tidy数据接口

Bioconductor系统发育树操作与层级数据聚合包

生物学实验报告最小信息规范注册门户

Python生物数据多源统一获取工具

pandas分子数据扩展，PDB文件DataFrame接口

Nextflow企业级工作流编排平台，支持多云/集群管道管理

Zuckerberg/Chan生物医学慈善基金，核心方向：单细胞/神经/开放科学

中国国家级博士后科研资助，面上/特别/博新计划三类基金

Benchling平台CRISPR设计模块，gRNA设计和实验追踪一体化

欧洲最大科研职位平台，覆盖学术和产业界各学科岗位

Biognosys专业DIA蛋白质组学商业软件，支持directDIA模式

GxP合规流式分析软件，21 CFR Part 11，适合临床和制药QC

云端流式/质谱流式分析平台，FlowSOM和viSNE高维可视化

BD旗下流式细胞术分析软件，安装量最大，.wsp为行业标准格式

盖茨基金会全球卫生项目，累计770亿美元捐赠的核心方向

欧盟前沿研究资助机构，Starting/Consolidator/Advanced三类核心基金

QIAGEN旗舰NGS分析商业软件，图形化工作流无代码分析

美国人类研究保护办公室，实施45 CFR 46和IRB审查制度

NIH科学政策办公室，管理重组DNA指南和生物安全政策

WHO全球实验室生物安全标准制定机构，发布生物安全手册

EBCC泛欧洲30+国家常见鸟类种群趋势监测

挪威生态数据整合与开放科学网络

NSF资助1.5亿+自然历史标本数字化数据门户

欧洲分类学设施联盟，5亿+标本数字化协调

IUCN物种恢复与保护影响量化评估框架

全球协作对全部真核生物测序的宏伟计划

加拿大蝴蝶物候与分布公民科学监测平台

iNaturalist澳大利亚节点，集成本土分类学数据

欧盟14000+外来入侵物种信息系统

澳大利亚1亿+物种出现国家生物多样性平台

互联网最古老的生命之树协作式项目

iNaturalist加拿大节点，本土化物种观测平台

全球33000+水生物种计算机生成分布图系统

环境DNA生物监测全流程在线分析平台

Pinello实验室CRISPR筛选端到端数据分析流水线

Broad研究所CRISPR/RNAi筛选文库设计与分析门户

计算机辅助基因治疗载体工程化设计平台

基因治疗病毒载体设计与应用资源数据库

面向基因组学的自动化机器学习平台

Pinello实验室CRISPR编辑效率NGS数据分析工具

Broad Institute深度学习剪接变异在线预测

免费在线密码子适应指数计算与优化工具

自动化基因合成寡核苷酸设计工具

张锋实验室CRISPR筛选实验设计与gRNA文库指南

ATCC基于STR分型的细胞系身份认证服务

一站式载体设计与基因构建服务平台

Benchling结构化生物学电子实验记录模块

端到端DNA序列设计与克隆规划云平台

GenScript免费在线密码子优化工具

Theis Lab单细胞动力学工具，马尔可夫链模型预测细胞命运

Broad Institute大规模基因组分析框架，基于Spark，UKB GWAS基础设施

Intel/Broad高性能基因组变异存储系统，GATK4默认gVCF合并后端

开源多组学机器学习平台，交互式生物标志物发现工具

EMBL-EBI非编码RNA家族数据库，4000+家族含协方差模型

miRNA序列和注释权威数据库，提供标准化miRNA命名

Ensembl变异功能注释工具，最广泛使用的变异注释软件

R交互式流式细胞术分析包，开源免费的FlowJo替代方案

MRC-IEU GWAS摘要统计数据库，4万+研究含MR分析API

TCGA肿瘤免疫组学数据库，含TCR/BCR/新抗原/TIL数据

Baker Lab全原子版RFdiffusion，支持侧链级精确蛋白质设计

10x Genomics空间转录组分析软件，Visium/Visium HD全流程

Babraham NGS自动预处理工具，Cutadapt+FastQC封装器

罗马大学实验验证蛋白质互作数据库，IMEx联盟成员

Sanger研究所自动细胞类型注释工具，100+免疫细胞亚型模型

蛋白质结合口袋可药性(druggability)预测工具

蛋白质结构检索与药物设计导向比较分析平台

Lehigh大学MD模拟系统构建Web平台

Sandia大规模并行分子动力学模拟器

BioExcel高性能GROMACS优化版本

TM-score蛋白质结构相似性评分在线服务

2亿+AlphaFold结构预测聚类数据库

张阳实验室基于TM-score的蛋白质结构比对工具

蛋白质3D结构比对与折叠相似性搜索服务器

综合性晶体学结构精修与验证软件套件

MRC-LMB晶体学模型构建与验证软件

整合动力学分析的蛋白质突变效应预测服务器

EBI蛋白质-配体2D相互作用图自动生成工具

基于Voronoi镶嵌的蛋白质结合口袋检测工具

自动化蛋白质-配体非共价相互作用分析工具

计算机辅助分子结构分析平台

蛋白质折叠转换（变形蛋白）数据库

图神经网络蛋白质-蛋白质相互作用预测工具

基于扩散模型的抗体CDR环生成设计工具

蛋白质优化进化Transformer工程应用模型

Stability AI蛋白质生成扩散模型研究项目

结合序列设计与蛋白质热稳定性预测的深度学习工具

探索端到端蛋白质结构预测架构改进

DeepMind更新版蛋白质复合物预测模型

超快蛋白质结构搜索与比对引擎

DeepMind长距离基因表达调控预测模型

Rost实验室蛋白质功能综合预测在线服务器

BIOVIA科学数据分析与工作流自动化平台

分子机器学习标准基准测试套件

Broad研究所泛癌显著突变基因与频率门户

IUPHAR药理学靶点与配体定量数据库

溶瘤病毒免疫治疗研究资源数据库

北大泛癌基因表达交互式分析Web服务器

斯坦福大学非编码遗传变异调控功能注释数据库

MSKCC 3D聚类癌症热点突变数据库

多数据集癌症药物敏感性统一整合数据库

TCGA 33癌种11000+样本泛癌多组学图谱

MSKCC 505基因癌症临床靶向测序组合

港大肿瘤-免疫互作多源整合数据库

致癌蛋白质-蛋白质相互作用数据库

AACR 100万+肿瘤临床测序基因组学数据共享项目

Sanger研究所致癌基因系统目录

Sanger研究所324个癌细胞系全基因组CRISPR筛选

实体瘤综合生物标志物快速探索Web应用

酵母合成生物学标准化构建与基因组工程平台

CRISPR全基因组功能筛选标准化分析平台

合成生物学多细胞系统涌现行为模拟工具

商业化合成生物学端到端设计与管理平台

面向合成生物学的高通量DNA自动化组装服务

自动化位点特异性重组酶系统计算设计工具

合成生物学计算机辅助设计自动化框架

全球首个合成生物学标准化自动化生产设施

Python灵活的DNA序列多约束优化工具

合成生物学DBTL循环全流程数字化管理平台

SBML标准生化网络可视化建模与仿真工具

NEB全线DNA组装产品，Gibson/Golden Gate方案

基因调控网络建模工具，支持振荡器与传感器设计

BioBrick部件综合数据库与分析平台

集成基因回路设计与模拟环境，iBioSim后端

抗体CDR多编号系统在线分析与构象分类

全球抗体唯一标识符RRID注册系统

牛津大学SARS-CoV-2抗体序列结构与功能数据库

牛津大学治疗性抗体3D结构临床信息数据库

抗体序列公共数据库与大规模挖掘平台

UCL整合抗体序列与结构分析数据库

独立抗体验证数据库与供应商比较平台

T细胞受体序列距离度量与聚类工具

NGS数据HLA I类高精度分型工具，99%+准确率

全球最大HLA等位基因频率数据库，覆盖1000+人群

IEDB B细胞构象表位预测工具

CTL表位综合预测工具，整合MHC结合+蛋白酶体+TAP

开源MHC I类肽结合预测工具

个性化肿瘤疫苗新抗原排名工具

纳米抗体/单域抗体专业数据库

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利用多基因组数据的高分辨率种群历史推断工具

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哈佛Reich实验室古基因组数据与分析工具

MPI-EVA古DNA研究方法与工具资源页

单倍型定相与网络构建集成工具，5种重建方法

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全基因组SNP群体系统发育树快速构建工具

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群体结构分析最大似然法软件，STRUCTURE加速替代

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DNA序列多态性分析专用软件，群体遗传学经典

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单细胞RNA-seq分析方法基准测试数据与工具包

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Python电生理数据分析工具包，脉冲列车分析利器

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BRAIN Initiative神经生理数据公共存档库

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帕金森病多组学数据云端分析平台

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植物转录因子数据库v4.0超180物种

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