📁 富集分析与通路分析工具 (23 个工具)
B
Babelomics
富集分析与通路分析
在线功能分析平台,差异表达+富集+通路一体化
G
GeneMANIA
富集分析与通路分析
基因网络扩展与功能预测工具,多源加权整合PPI
IntAct
富集分析与通路分析
EBI分子互作数据库,IMEx联盟核心成员
P
PathVisio
富集分析与通路分析
通路可视化与编辑工具,表达数据映射通路图展示
C
ConsensusPathDB
富集分析与通路分析
通路与互作整合数据库,20+来源的通路过表达与PPI扩展
fgsea
富集分析与通路分析
快速GSEA的R实现,预排列策略加速数百倍
P
PANTHER
富集分析与通路分析
蛋白质进化分类与功能富集平台,GO/通路富集分析
GOrilla
富集分析与通路分析
基于排序基因列表的GO富集工具,无需阈值的层级可视化
W
WikiPathways
富集分析与通路分析
社区维护的开放通路数据库,Wiki模式的通路编辑与共享
W
WebGestalt
富集分析与通路分析
在线基因集富集分析工具包,ORA+GSEA双模式300+物种
G
GOplot
富集分析与通路分析
R语言GO富集可视化包,表达-富集联合展示
topGO
富集分析与通路分析
R语言GO富集分析包,利用拓扑结构消除层级冗余
Pathway Commons
富集分析与通路分析
通路与互作数据整合平台,多源统一的信号通路一站式检索
B
BioGRID
富集分析与通路分析
人工审校的实验验证蛋白质互作数据库,200万+互作对
STRING
富集分析与通路分析
蛋白质互作网络数据库,多证据来源的PPI网络与功能富集
M
MSigDB
富集分析与通路分析
分子签名基因集数据库,30,000+基因集的GSEA标准来源
R
Reactome
富集分析与通路分析
专家审校的人类生物学通路数据库,高质量信号转导通路注释
KEGG
富集分析与通路分析
京都基因与基因组百科全书,最权威的通路参考数据库
G
GSEA
富集分析与通路分析
基因集富集分析方法,无需阈值的全谱排序富集分析
E
Enrichr
富集分析与通路分析
300+注释库的基因列表富集分析工具,一键功能解读
c
clusterProfiler
富集分析与通路分析
R语言富集分析核心包,ORA+GSEA+多维可视化
g
g:Profiler
富集分析与通路分析
多功能富集分析平台,500+物种的GO/KEGG/Reactome富集
D
DAVID
富集分析与通路分析
基因列表功能富集分析经典工具,GO/KEGG/BioCarta一站式富集