📁 富集分析与通路分析工具 (23 个工具)

B
Babelomics
富集分析与通路分析

在线功能分析平台,差异表达+富集+通路一体化

G
GeneMANIA
富集分析与通路分析

基因网络扩展与功能预测工具,多源加权整合PPI

IntAct
IntAct
富集分析与通路分析

EBI分子互作数据库,IMEx联盟核心成员

P
PathVisio
富集分析与通路分析

通路可视化与编辑工具,表达数据映射通路图展示

C
ConsensusPathDB
富集分析与通路分析

通路与互作整合数据库,20+来源的通路过表达与PPI扩展

fgsea
fgsea
富集分析与通路分析

快速GSEA的R实现,预排列策略加速数百倍

P
PANTHER
富集分析与通路分析

蛋白质进化分类与功能富集平台,GO/通路富集分析

GOrilla
GOrilla
富集分析与通路分析

基于排序基因列表的GO富集工具,无需阈值的层级可视化

W
WikiPathways
富集分析与通路分析

社区维护的开放通路数据库,Wiki模式的通路编辑与共享

W
WebGestalt
富集分析与通路分析

在线基因集富集分析工具包,ORA+GSEA双模式300+物种

G
GOplot
富集分析与通路分析

R语言GO富集可视化包,表达-富集联合展示

topGO
topGO
富集分析与通路分析

R语言GO富集分析包,利用拓扑结构消除层级冗余

Pathway Commons
Pathway Commons
富集分析与通路分析

通路与互作数据整合平台,多源统一的信号通路一站式检索

B
BioGRID
富集分析与通路分析

人工审校的实验验证蛋白质互作数据库,200万+互作对

STRING
STRING
富集分析与通路分析

蛋白质互作网络数据库,多证据来源的PPI网络与功能富集

M
MSigDB
富集分析与通路分析

分子签名基因集数据库,30,000+基因集的GSEA标准来源

R
Reactome
富集分析与通路分析

专家审校的人类生物学通路数据库,高质量信号转导通路注释

KEGG
KEGG
富集分析与通路分析

京都基因与基因组百科全书,最权威的通路参考数据库

G
GSEA
富集分析与通路分析

基因集富集分析方法,无需阈值的全谱排序富集分析

E
Enrichr
富集分析与通路分析

300+注释库的基因列表富集分析工具,一键功能解读

c
clusterProfiler
富集分析与通路分析

R语言富集分析核心包,ORA+GSEA+多维可视化

g
g:Profiler
富集分析与通路分析

多功能富集分析平台,500+物种的GO/KEGG/Reactome富集

D
DAVID
富集分析与通路分析

基因列表功能富集分析经典工具,GO/KEGG/BioCarta一站式富集