📁 蛋白质结构预测与建模工具 (19 个工具)
AF2Complex
蛋白质结构预测与建模
AlphaFold2多聚体扩展,蛋白质复合物互作界面预测
EvoEF2
蛋白质结构预测与建模
物理力场蛋白质稳定性预测工具,泛化性强的ΔΔG计算
Rosetta
蛋白质结构预测与建模
Baker Lab蛋白质建模设计套件,蒙特卡洛构象采样标准
Phyre2
蛋白质结构预测与建模
Imperial远程同源建模服务器,低同源性模板检测
Modeller
蛋白质结构预测与建模
Sali Lab同源建模经典工具,空间约束比较建模
F
FoldX
蛋白质结构预测与建模
蛋白质稳定性预测工具,经验力场快速ΔΔG计算
CarbonDesign
蛋白质结构预测与建模
AI蛋白质设计工具,结构生成与序列设计整合
DMPfold2
蛋白质结构预测与建模
UCL深度学习距离预测结构建模,轻量快速蛋白质折叠
RFdiffusion
蛋白质结构预测与建模
Baker Lab扩散模型蛋白质设计,从头生成功能蛋白质
LigandMPNN
蛋白质结构预测与建模
配体感知蛋白质序列设计,小分子结合口袋优化序列生成
ProteinMPNN
蛋白质结构预测与建模
Baker Lab蛋白质逆折叠序列设计,骨架条件MPNN序列生成
OpenFold
蛋白质结构预测与建模
AlphaFold2开源PyTorch复现,可训练可修改的代码基础
OmegaFold
蛋白质结构预测与建模
Helixon蛋白质语言模型预测,免MSA快速结构折叠
t
trRosetta
蛋白质结构预测与建模
南开大学距离约束结构预测,残基间距离神经网络+Rosetta
I
I-TASSER
蛋白质结构预测与建模
密歇根大学线程法结构预测平台,结构+功能联合预测
Swiss-Model
蛋白质结构预测与建模
SIB自动化同源建模服务器,经典蛋白质模板建模平台
RoseTTAFold2
蛋白质结构预测与建模
Baker Lab三轨网络结构预测,CASP15优异表现
ESMFold
蛋白质结构预测与建模
Meta AI蛋白质语言模型结构预测,无需MSA的快速折叠
C
ColabFold
蛋白质结构预测与建模
AlphaFold2在线优化版,Google Colab免费蛋白质结构预测