📁 蛋白质结构预测与建模工具 (19 个工具)

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蛋白质结构预测与建模

AlphaFold2多聚体扩展,蛋白质复合物互作界面预测

EvoEF2
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蛋白质结构预测与建模

物理力场蛋白质稳定性预测工具,泛化性强的ΔΔG计算

Rosetta
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蛋白质结构预测与建模

Baker Lab蛋白质建模设计套件,蒙特卡洛构象采样标准

Phyre2
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蛋白质结构预测与建模

Imperial远程同源建模服务器,低同源性模板检测

Modeller
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蛋白质结构预测与建模

Sali Lab同源建模经典工具,空间约束比较建模

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FoldX
蛋白质结构预测与建模

蛋白质稳定性预测工具,经验力场快速ΔΔG计算

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蛋白质结构预测与建模

AI蛋白质设计工具,结构生成与序列设计整合

DMPfold2
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蛋白质结构预测与建模

UCL深度学习距离预测结构建模,轻量快速蛋白质折叠

RFdiffusion
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蛋白质结构预测与建模

Baker Lab扩散模型蛋白质设计,从头生成功能蛋白质

LigandMPNN
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蛋白质结构预测与建模

配体感知蛋白质序列设计,小分子结合口袋优化序列生成

ProteinMPNN
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蛋白质结构预测与建模

Baker Lab蛋白质逆折叠序列设计,骨架条件MPNN序列生成

OpenFold
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蛋白质结构预测与建模

AlphaFold2开源PyTorch复现,可训练可修改的代码基础

OmegaFold
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蛋白质结构预测与建模

Helixon蛋白质语言模型预测,免MSA快速结构折叠

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trRosetta
蛋白质结构预测与建模

南开大学距离约束结构预测,残基间距离神经网络+Rosetta

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I-TASSER
蛋白质结构预测与建模

密歇根大学线程法结构预测平台,结构+功能联合预测

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蛋白质结构预测与建模

SIB自动化同源建模服务器,经典蛋白质模板建模平台

RoseTTAFold2
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蛋白质结构预测与建模

Baker Lab三轨网络结构预测,CASP15优异表现

ESMFold
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蛋白质结构预测与建模

Meta AI蛋白质语言模型结构预测,无需MSA的快速折叠

C
ColabFold
蛋白质结构预测与建模

AlphaFold2在线优化版,Google Colab免费蛋白质结构预测