全部工具 (32 个工具)
M
MuPIT
癌症数据挖掘
癌症体细胞突变蛋白质3D结构映射工具
F
FoundationOne CDx
癌症数据挖掘
FDA批准广谱癌症伴随诊断NGS检测
C
CPTAC
癌症数据挖掘
NCI肿瘤临床蛋白质组学联盟,泛癌多组学数据
H
HLA-Arena
癌症数据挖掘
肽-HLA复合物结构建模与分析环境
s
scDrugAct
癌症数据挖掘
肿瘤微环境单细胞药物响应与耐药数据库
T
TIMER2.0
癌症数据挖掘
肿瘤免疫浸润分析Web服务器,多算法整合
T
TISCH
癌症数据挖掘
肿瘤微环境单细胞转录组大规模数据库
T
TIMEDB
癌症数据挖掘
肿瘤免疫微环境细胞组成综合数据库
T
TCIA
癌症数据挖掘
NCI癌症影像公共数据库,影像基因组学首选
S
SurvExpress
癌症数据挖掘
癌症生存分析在线工具,基因签名预后价值评估
C
CancerMine
癌症数据挖掘
文献挖掘癌症基因知识库,NLP提取基因-药物关联
P
PCAWG
癌症数据挖掘
泛癌症全基因组分析项目,2,600+癌症WGS里程碑数据
G
GDSC
癌症数据挖掘
Sanger癌症药物敏感性基因组学,1,000药×1,000细胞系
D
DepMap
癌症数据挖掘
Broad癌症依赖图谱平台,CRISPR全基因组筛选靶点发现
C
Cancer Cell Line Encyclopedia
癌症数据挖掘
Broad癌细胞系百科全书,1,800+细胞系组学与药敏数据
S
Signal
癌症数据挖掘
Sanger突变签名分析平台,SBS/DBS/Indel病因分解
IntOGen
癌症数据挖掘
7方法整合癌症驱动基因发现平台,泛癌症驱动图谱
dNdScv
癌症数据挖掘
Sanger dN/dS选择压力分析工具,癌症正向选择基因检测
OncodriveFML
癌症数据挖掘
功能水平癌症驱动突变检测工具,非编码驱动元件发现
MutSigCV
癌症数据挖掘
Broad癌症显著突变基因检测工具,驱动基因统计鉴定
G
GISTIC2.0
癌症数据挖掘
Broad拷贝数显著区域检测工具,癌症驱动CNV鉴定
OncoGEMINI
癌症数据挖掘
肿瘤内异质性分析工具,多区域测序克隆进化推断
maftools
癌症数据挖掘
MSKCC MAF文件处理R包,TCGA突变oncoplot标准工具
MutScape
癌症数据挖掘
癌症体细胞突变可视化R包,MAF文件统计分析与瀑布图
C
CellMiner
癌症数据挖掘
NCI癌细胞系数据分析工具,NCI-60组学与药敏关联
PharmGKB
癌症数据挖掘
Stanford药物基因组学知识库,变异-药物反应临床注释
CIViC
癌症数据挖掘
社区驱动癌症变异临床知识库,开放审校变异-药物证据
OncoKB
癌症数据挖掘
MSKCC精准肿瘤学知识库,变异-药物临床证据分级注释
U
UCSC Xena
癌症数据挖掘
UCSC癌症多组学可视化分析平台,TCGA/GTEx在线探索
COSMIC
癌症数据挖掘
Sanger癌症体细胞突变目录,1,500万+体细胞变异注释