全部工具 (32 个工具)

M
MuPIT
癌症数据挖掘

癌症体细胞突变蛋白质3D结构映射工具

F
FoundationOne CDx
癌症数据挖掘

FDA批准广谱癌症伴随诊断NGS检测

C
CPTAC
癌症数据挖掘

NCI肿瘤临床蛋白质组学联盟,泛癌多组学数据

H
HLA-Arena
癌症数据挖掘

肽-HLA复合物结构建模与分析环境

s
scDrugAct
癌症数据挖掘

肿瘤微环境单细胞药物响应与耐药数据库

T
TIMER2.0
癌症数据挖掘

肿瘤免疫浸润分析Web服务器,多算法整合

T
TISCH
癌症数据挖掘

肿瘤微环境单细胞转录组大规模数据库

T
TIMEDB
癌症数据挖掘

肿瘤免疫微环境细胞组成综合数据库

T
TCIA
癌症数据挖掘

NCI癌症影像公共数据库,影像基因组学首选

S
SurvExpress
癌症数据挖掘

癌症生存分析在线工具,基因签名预后价值评估

C
CancerMine
癌症数据挖掘

文献挖掘癌症基因知识库,NLP提取基因-药物关联

P
PCAWG
癌症数据挖掘

泛癌症全基因组分析项目,2,600+癌症WGS里程碑数据

G
GDSC
癌症数据挖掘

Sanger癌症药物敏感性基因组学,1,000药×1,000细胞系

D
DepMap
癌症数据挖掘

Broad癌症依赖图谱平台,CRISPR全基因组筛选靶点发现

C
Cancer Cell Line Encyclopedia
癌症数据挖掘

Broad癌细胞系百科全书,1,800+细胞系组学与药敏数据

S
Signal
癌症数据挖掘

Sanger突变签名分析平台,SBS/DBS/Indel病因分解

IntOGen
IntOGen
癌症数据挖掘

7方法整合癌症驱动基因发现平台,泛癌症驱动图谱

dNdScv
dNdScv
癌症数据挖掘

Sanger dN/dS选择压力分析工具,癌症正向选择基因检测

OncodriveFML
OncodriveFML
癌症数据挖掘

功能水平癌症驱动突变检测工具,非编码驱动元件发现

MutSigCV
MutSigCV
癌症数据挖掘

Broad癌症显著突变基因检测工具,驱动基因统计鉴定

G
GISTIC2.0
癌症数据挖掘

Broad拷贝数显著区域检测工具,癌症驱动CNV鉴定

OncoGEMINI
OncoGEMINI
癌症数据挖掘

肿瘤内异质性分析工具,多区域测序克隆进化推断

maftools
maftools
癌症数据挖掘

MSKCC MAF文件处理R包,TCGA突变oncoplot标准工具

MutScape
MutScape
癌症数据挖掘

癌症体细胞突变可视化R包,MAF文件统计分析与瀑布图

C
CellMiner
癌症数据挖掘

NCI癌细胞系数据分析工具,NCI-60组学与药敏关联

PharmGKB
PharmGKB
癌症数据挖掘

Stanford药物基因组学知识库,变异-药物反应临床注释

CIViC
CIViC
癌症数据挖掘

社区驱动癌症变异临床知识库,开放审校变异-药物证据

OncoKB
OncoKB
癌症数据挖掘

MSKCC精准肿瘤学知识库,变异-药物临床证据分级注释

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UCSC Xena
癌症数据挖掘

UCSC癌症多组学可视化分析平台,TCGA/GTEx在线探索

COSMIC
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癌症数据挖掘

Sanger癌症体细胞突变目录,1,500万+体细胞变异注释