📁 微生物组分析工具 (34 个工具)

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PyParanoid
微生物组分析

Python InParanoid泛基因组同源群识别工具

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Panaroo
微生物组分析

精化原核泛基因组构建与质控流程

PAN-genome Viz
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微生物组分析

分区泛基因组图构建与可视化工具

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MAG分类污染识别与纯化工具

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快速MAG相对丰度与覆盖度计算工具

GUNC
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基因组非一致嵌合体MAG质量检测工具

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微生物组分析

基于ANI的微生物MAG去冗余与代表性选择工具

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CheckM
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MAG完整性与污染度质量评估工具

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Woltu
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QIIME2机器学习样本表型分类插件

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BioBakery端到端微生物组分析一站式流水线

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蛋白级翻译搜索快速宏基因组分类工具

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Centrifuge
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基于FM-index的低内存宏基因组分类工具

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基于唯一k-mer匹配的高精度宏基因组分类工具

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BugBase
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微生物组九种功能表型预测工具

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微生物组日志比差异可视化工具

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机器学习微生物组差异排名工具

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用户友好微生物组统计与代谢组整合web平台

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系统发育感知Beta多样性UniFrac距离工具

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菌株级微生物系统发育与SNP分析工具

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SparCC
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组成型微生物组数据稀疏相关推断工具

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STAMP
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微生物组数据统计检验与可视化GUI工具

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Tax4Fun2
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栖息地特异性微生物功能预测工具

ALDEx2
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组成型微生物组数据差异丰度分析R包

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Kraken2
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基于k-mer的超快宏基因组序列分类器

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HUMAnN
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宏基因组功能注释与代谢通路定量工具

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基于标记基因的宏基因组快速物种注释工具

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phyloseq (R)
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R语言微生物组数据导入与分析框架

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R语言群落生态学与多样性分析核心包

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免费在线微生物组综合分析平台

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组间差异生物标志物发现与LDA分析工具