📁 蛋白质互作与对接工具 (23 个工具)

MolProbity
MolProbity
蛋白质互作与对接

Duke蛋白质立体化学验证工具,Ramachandran质控标准

P
ProSA
蛋白质互作与对接

蛋白质结构验证工具,Z-score模型质量评估标准

N
NPDock
蛋白质互作与对接

蛋白质-核酸专用对接工具,RNA/DNA-蛋白质复合物建模

Smina
Smina
蛋白质互作与对接

AutoDock Vina开源分支,自定义评分函数对接工具

F
FRODOCK
蛋白质互作与对接

BSC快速蛋白质对接工具,3D Zernike FFT加速表面匹配

P
PatchDock
蛋白质互作与对接

Tel Aviv几何表面匹配蛋白质对接,快速粗筛互补表面补丁

G
Glide
蛋白质互作与对接

Schrödinger高精度分子对接模块,XP/SP/HTVS三模式

D
DOCK
蛋白质互作与对接

UCSF经典分子对接程序,药物发现虚拟筛选传统标准

UCSF Chimera
UCSF Chimera
蛋白质互作与对接

UCSF经典分子可视化软件,结构分析功能成熟丰富

ChimeraX
ChimeraX
蛋白质互作与对接

UCSF下一代分子可视化软件,冷冻电镜与AlphaFold结构分析

P
PyMOL
蛋白质互作与对接

分子3D可视化标杆软件,结构生物学论文图表标准

H
HDOCK
蛋白质互作与对接

华中科技大学分子对接服务器,蛋白质-核酸/蛋白质-蛋白质双模式

L
LightDock
蛋白质互作与对接

萤火虫算法蛋白质对接框架,群体智能柔性对接

S
SwissDock
蛋白质互作与对接

SIB在线分子对接服务,EADock DSS配体结合预测

GNINA
GNINA
蛋白质互作与对接

深度学习CNN评分分子对接,Vina搜索+AI重评分

r
rDock
蛋白质互作与对接

开源分子对接工具,随机搜索算法虚拟筛选

C
CABS-Dock
蛋白质互作与对接

CABS粗粒度蛋白质-肽柔性对接工具,全局肽段结合模式搜索

RosettaDock
RosettaDock
蛋白质互作与对接

Rosetta蛋白质对接模块,蒙特卡洛全原子能量函数精细建模

Z
ZDOCK
蛋白质互作与对接

Washington University FFT刚体蛋白质对接,快速6D搜索筛选

C
ClusPro
蛋白质互作与对接

Boston University自动蛋白质对接服务器,免费在线PPI建模

HADDOCK
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蛋白质互作与对接

Utrecht数据驱动蛋白质对接工具,实验约束复合物建模

DiffDock
DiffDock
蛋白质互作与对接

MIT扩散模型分子对接,AI驱动配体-蛋白结合预测

AutoDock Vina
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蛋白质互作与对接

Scripps分子对接标准工具,小分子-蛋白质结合模式预测