📁 基因注释与变异预测工具 (22 个工具)

Human Splicing Finder
Human Splicing Finder
基因注释与变异预测

剪接位点突变效应预测工具,临床剪接变异评估辅助

M
MaxEntScan
基因注释与变异预测

MIT最大熵剪接位点评分工具,供体/受体位点强度评估

AlphaMissense
AlphaMissense
基因注释与变异预测

DeepMind AlphaFold架构变异预测,全人类蛋白质致病变异预计算

PrimateAI-3D
PrimateAI-3D
基因注释与变异预测

灵长类+3D结构深度学习变异预测,结构感知的致病性评估

FitCons
FitCons
基因注释与变异预测

群体遗传学功能约束评分,非编码位点选择系数估计

LINSIGHT
LINSIGHT
基因注释与变异预测

深度学习非编码功能预测工具,调控区变异约束评分

ClinPred
ClinPred
基因注释与变异预测

临床变异致病性集成预测工具,随机森林综合多评分排序

d
dbNSFP
基因注释与变异预测

预计算变异注释数据库,20+功能预测工具评分整合下载

M
MutationAssessor
基因注释与变异预测

蛋白质家族进化保守性预测工具,氨基酸替换四级功能评估

V
VarSome
基因注释与变异预测

变异综合查询注释平台,数十数据源一键ACMG分类建议

D
DeepSEA
基因注释与变异预测

Princeton深度学习调控变异预测,非编码变异的表观效应评估

G
GERP++
基因注释与变异预测

基因组进化约束评分工具,位点级保守性与选择压力分析

M
MutationTaster
基因注释与变异预测

变异致病性综合预测工具,序列与功能多维度疾病突变评估

F
FATHMM
基因注释与变异预测

HMM蛋白质功能变异预测工具,跨物种保守性与癌症突变评估

SpliceAI
SpliceAI
基因注释与变异预测

Illumina深度学习剪接预测工具,高灵敏度剪接变异检测

R
REVEL
基因注释与变异预测

13工具集成的非同义变异致病性预测,ACMG PP3推荐

C
CADD
基因注释与变异预测

综合变异致病性评分工具,60+特征统一评分全基因组变异

PolyPhen-2
PolyPhen-2
基因注释与变异预测

哈佛氨基酸替换功能预测工具,结构特征三级分类评估

S
SIFT
基因注释与变异预测

氨基酸替换功能影响预测经典工具,序列保守性评分

S
SnpEff
基因注释与变异预测

快速变异效应注释开源工具,38,000+物种基因组注释

VEP
VEP
基因注释与变异预测

Ensembl变异效应预测工具,多物种变异功能注释国际标准

ANNOVAR
ANNOVAR
基因注释与变异预测

变异注释权威命令行工具,多源功能与临床注释一站式