📁 CRISPR设计与分析工具 （21 个工具）

CRISPResso2

分子生物学与基因编辑

CRISPR编辑结果分析工具，NGS编辑效率量化标准

多Cas变体CRISPR设计工具，20,000+基因组覆盖的RGEN设计

CRISPick

分子生物学与基因编辑

Broad研究所CRISPR设计工具，Rule Set 2大规模验证的sgRNA评分

Off-Spotter

分子生物学与基因编辑

Sanger研究所CRISPR脱靶快速搜索工具，全基因组枚举验证

全基因组CRISPR sgRNA设计工具，优化筛选库特异性

FlashFry

分子生物学与基因编辑

快速CRISPR sgRNA命令行评估工具，全基因组范围筛选设计

Prime Editing设计工具，pegRNA与nick sgRNA的专业设计平台

华中农大植物CRISPR设计工具，农作物基因组编辑专业平台

CRISPR-DO

分子生物学与基因编辑

Cistrome CRISPR设计工具，整合染色质状态的sgRNA可及性评估

CRISPR脱靶位点搜索工具，支持多Cas变体和DNA/RNA bulge

CCTop

分子生物学与基因编辑

海德堡大学CRISPR靶位点预测工具，BWT快速脱靶搜索

sgRNA Scorer 2.0

分子生物学与基因编辑

NCI开发sgRNA评分工具，机器学习预测CRISPR效率

深度学习CRISPR效率预测工具，整合表观遗传特征的sgRNA评分

CRISPRdirect

分子生物学与基因编辑

快速CRISPR sgRNA搜索工具，全基因组范围脱靶枚举

CRISPR sgRNA设计工具，独特评分算法的脱靶评估

IDT CRISPR Design

分子生物学与基因编辑

IDT Alt-R CRISPR设计工具，预合成crRNA订购整合

Synthego CRISPR设计工具，sgRNA设计到合成一站式服务

Benchling

分子生物学与基因编辑

云端生命科学研发平台，CRISPR设计与序列编辑一体化

基于斑马鱼数据的CRISPR sgRNA效率预测工具

CHOPCHOP

分子生物学与基因编辑

CRISPR sgRNA设计工具，400+基因组覆盖的基因敲除设计

CRISPR sgRNA设计一站式工具，500+基因组脱靶与效率评分