数据库与数据资源（214 个工具）

CZI单细胞转录组发现和可视化平台，数百万细胞交互浏览

公开生物图像数据存储库，含1400万+图像和FAIR数据原则

幻方AI高性能AlphaFold2推理加速框架，支持大规模批量预测

深势科技开源国产AlphaFold2复现，支持华为昇腾平台

UCSF免费化合物数据库，含数亿可购买分子用于虚拟筛选

基于图签名的ADMET预测平台，涵盖30种药代/毒性预测

最广泛使用的开源分子动力学模拟软件，GPU加速高性能计算

UCSF经典分子动力学套件，AMBER力场为蛋白质模拟标准

UIUC大规模并行分子动力学软件，支持超算和完整病毒模拟

GitHub计算生物学精选列表，侧重AI/深度学习生物学应用

基于深度学习的DIA蛋白质组学开源工具，支持无库快速分析

最广泛使用的开源代谢组学质谱数据处理软件，模块化工作流

UCSD质谱分子网络平台，串联质谱可视化和天然产物发现

McGill代谢组学统计分析在线平台，含通路富集和标志物分析

马普所超快速序列搜索和聚类工具，ColabFold的MSA后端

基因本体论国际组织，450万+注释，三大本体标准词汇体系

中国观鸟记录中心公民科学平台，汇集数十万鸟类分布记录

EMBL-EBI单细胞基因表达图谱，多物种统一细胞类型注释

欧洲开源质谱参考数据库，高分辨率代谢物MS/MS谱图

罗马大学实验验证蛋白质互作数据库，IMEx联盟成员

MRC-IEU GWAS摘要统计数据库，4万+研究含MR分析API

miRNA序列和注释权威数据库，提供标准化miRNA命名

EMBL-EBI非编码RNA家族数据库，4000+家族含协方差模型

密歇根大学蛋白质组学分析管道，MSFragger搜索引擎提速100倍

基因组注释序列特征标准词汇，GFF3格式的术语基础

R交互式流式细胞术分析包，开源免费的FlowJo替代方案

开源多组学机器学习平台，交互式生物标志物发现工具

Ensembl变异功能注释工具，最广泛使用的变异注释软件

Intel/Broad高性能基因组变异存储系统，GATK4默认gVCF合并后端

TCGA肿瘤免疫组学数据库，含TCR/BCR/新抗原/TIL数据