Bioconductor treeio

站点概述

treeio是Bioconductor的系统发育树输入输出基础包，支持解析和导出多种树格式的文件。该包可读取BEAST、MrBayes、MEGA、RAxML、IQ-TREE和EPA等主流系统发育软件的输出文件，保留节点注释（如后验概率、分支长度和进化参数）。treeio还支持将树数据转换为tidy数据框，便于与dplyr和ggplot2等tidyverse工具配合使用。该包是ggtree可视化引擎的底层数据接口，是R语言系统发育数据流的核心枢纽。

官网与访问

官方网址：https://bioconductor.org/packages/treeio/。访问前请确认链接有效，并注意甄别仿冒站点。

分类归属

所属一级分类：生物信息学；二级方向：R包与Bioconductor。资源类型：资源。

主要标签

treeio、树I/O、系统发育、R、BEAST

主要用途

用于「生物信息学 · R包与Bioconductor」方向的科研查询、工具调用与资源获取，辅助生物学科研、教学与产业应用。

适用人群

生命科学领域的科研人员、高校师生（本科/硕士/博士）、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。

使用建议

建议优先访问官方网站或机构页面，注意核对域名与版本；对需要账号/权限的资源，优先使用所在机构已采购的数据库权限，并遵守数据使用协议与引用规范。

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小结

Bioconductor treeio 已纳入生物导航站的「生物信息学 · R包与Bioconductor」分类，结合上方概述、用途与建议，可帮助你在生物学科研与学习中更快找到权威、可靠的资源入口。