JCat (Java Codon Adaptation Tool)

站点概述

JCat（Java Codon Adaptation Tool）是免费的在线密码子优化工具，根据目标生物的密码子使用偏好对基因序列进行优化。该工具计算密码子适应指数（CAI）并据此调整密码子选择，同时避免限制酶位点和核糖体结合位点的意外引入。JCat支持细菌、酵母和哺乳动物等主要表达宿主，用户也可上传自定义密码子使用表。优化结果提供CAI评分和密码子使用频率对比图，方便评估优化效果。该工具是异源蛋白表达实验中序列优化的标准在线工具之一。

官网与访问

官方网址：http://www.jcat.de/。访问前请确认链接有效，并注意甄别仿冒站点。

分类归属

所属一级分类：分子生物学与基因编辑；二级方向：分子克隆与试剂。资源类型：资源。

主要标签

JCat、密码子优化、CAI、表达优化、异源表达

主要用途

用于「分子生物学与基因编辑 · 分子克隆与试剂」方向的科研查询、工具调用与资源获取，辅助生物学科研、教学与产业应用。

适用人群

生命科学领域的科研人员、高校师生（本科/硕士/博士）、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。

使用建议

建议优先访问官方网站或机构页面，注意核对域名与版本；对需要账号/权限的资源，优先使用所在机构已采购的数据库权限，并遵守数据使用协议与引用规范。

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小结

JCat (Java Codon Adaptation Tool) 已纳入生物导航站的「分子生物学与基因编辑 · 分子克隆与试剂」分类，结合上方概述、用途与建议，可帮助你在生物学科研与学习中更快找到权威、可靠的资源入口。