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📁微生物组与宏基因组（56 个工具）

全部微生物组与宏基因组微生物组分析微生物数据库
P
PyParanoid
微生物组分析

Python InParanoid泛基因组同源群识别工具

同源群泛基因组
0
P
Panaroo
微生物组分析

精化原核泛基因组构建与质控流程

泛基因组图构建
0
PAN-genome Viz
PAN-genome Viz
微生物组分析

分区泛基因组图构建与可视化工具

泛基因组可视化
0
MAGpurify
MAGpurify
微生物组分析

MAG分类污染识别与纯化工具

MAG纯化污染去除
0
CoverM
CoverM
微生物组分析

快速MAG相对丰度与覆盖度计算工具

基因组丰度快速
0
GUNC
GUNC
微生物组分析

基因组非一致嵌合体MAG质量检测工具

嵌合体检测MAG质量
0
dRep
dRep
微生物组分析

基于ANI的微生物MAG去冗余与代表性选择工具

去冗余MAG
0
C
CheckM
微生物组分析

MAG完整性与污染度质量评估工具

基因组完整性污染检查
0
GTD2b
GTD2b
微生物数据库

细菌古菌基因组标准分类数据库GTDB

基因组分类标准分类
0
Mgnify AMR
Mgnify AMR
微生物数据库

MGnify宏基因组抗微生物抗性基因分析

抗性基因宏基因组
0
S
SPIRE
微生物数据库

全球宏基因组生境与地理注释数据库

全球微生物组生境注释
0
W
Woltu
微生物组分析

QIIME2机器学习样本表型分类插件

机器学习分类
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biobakery_workflows
biobakery_workflows
微生物组分析

BioBakery端到端微生物组分析一站式流水线

完整流程HUMAnN
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Kaiju
Kaiju
微生物组分析

蛋白级翻译搜索快速宏基因组分类工具

蛋白级分类翻译搜索
0
C
Centrifuge
微生物组分析

基于FM-index的低内存宏基因组分类工具

分类FM-index
0
K
KrakenUniq
微生物组分析

基于唯一k-mer匹配的高精度宏基因组分类工具

分类k-mer
0
B
BugBase
微生物组分析

微生物组九种功能表型预测工具

功能表型16S
0
Qurro
Qurro
微生物组分析

微生物组日志比差异可视化工具

日志比可视化
0
Songbird
Songbird
微生物组分析

机器学习微生物组差异排名工具

差异排名机器学习
0
MicrobiomeAnalyst2
MicrobiomeAnalyst2
微生物组分析

用户友好微生物组统计与代谢组整合web平台

统计分析功能预测
0
UniFrac
UniFrac
微生物组分析

系统发育感知Beta多样性UniFrac距离工具

Beta多样性系统发育距离
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StrainPhlAn
StrainPhlAn
微生物组分析

菌株级微生物系统发育与SNP分析工具

菌株水平系统发育
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F
FAPROTAX
微生物数据库

原核分类群代谢与生态功能手动注释数据库

功能注释原核分类群
0
A
AnnoTree
微生物数据库

原核生物功能注释系统发育树可视化

功能注释系统发育树
0
p
proGenomes3
微生物数据库

原核生物参考基因组与功能注释数据库

原核基因组参考基因组
0
G
GutViromeDatabase
微生物数据库

人类肠道病毒组与噬菌体基因组数据库

病毒组肠道噬菌体
0
HumGut
HumGut
微生物数据库

人类肠道微生物高质量参考基因组集合

肠道基因组人类微生物
0
M
MarineMetagenomeDB
微生物数据库

海洋宏基因组标准化元数据库

海洋宏基因组元数据
0
A
AnimalMetagenomeDB
微生物数据库

动物宏基因组测序数据与元数据库

动物宏基因组宿主信息
0
C
CRAMdb
微生物数据库

动物微生物组组成与宿主表型关联数据库

动物微生物组成
0