📁微生物组与宏基因组 / 微生物数据库(22 个工具)

GTD2b
GTD2b
bio-l2-16-2

细菌古菌基因组标准分类数据库GTDB

Mgnify AMR
Mgnify AMR
bio-l2-16-2

MGnify宏基因组抗微生物抗性基因分析

S
SPIRE
bio-l2-16-2

全球宏基因组生境与地理注释数据库

F
FAPROTAX
bio-l2-16-2

原核分类群代谢与生态功能手动注释数据库

A
AnnoTree
bio-l2-16-2

原核生物功能注释系统发育树可视化

p
proGenomes3
bio-l2-16-2

原核生物参考基因组与功能注释数据库

G
GutViromeDatabase
bio-l2-16-2

人类肠道病毒组与噬菌体基因组数据库

HumGut
HumGut
bio-l2-16-2

人类肠道微生物高质量参考基因组集合

M
MarineMetagenomeDB
bio-l2-16-2

海洋宏基因组标准化元数据库

A
AnimalMetagenomeDB
bio-l2-16-2

动物宏基因组测序数据与元数据库

C
CRAMdb
bio-l2-16-2

动物微生物组组成与宿主表型关联数据库

H
Human MetagenomeDB
bio-l2-16-2

人宏基因组数据搜索数据库

BacDive
BacDive
bio-l2-16-2

细菌与古菌表型数据与培养信息数据库

g
gutMEGA
bio-l2-16-2

肠道宏基因组条件关联高级搜索数据库

G
GMrepo
bio-l2-16-2

手动筛选的人肠道微生物组-表型关联数据库

E
EUKARYOME
bio-l2-16-2

真核生物rRNA基因综合参考数据库

M
MG-RAST
bio-l2-16-2

Argonne宏基因组自动注释与分析平台

I
IMG/M
bio-l2-16-2

DOE JGI综合微生物基因组与宏基因组数据库

MGnify
MGnify
bio-l2-16-2

EBI宏基因组数据存档与标准化分析平台

R
RDP Classifier
bio-l2-16-2

朴素贝叶斯rRNA序列分类学分类器

G
Greengenes2
bio-l2-16-2

新一代16S rRNA系统发育参考数据库

SILVA
SILVA
bio-l2-16-2

手动注释的综合rRNA参考数据库