💡 RegulomeDB 是什么?

站点概述

RegulomeDB是非编码遗传变异功能注释数据库,由斯坦福大学开发,整合了ENCODE和Roadmap Epigenomics等项目的功能基因组数据。该数据库对非编码变异的调控潜力进行评分,考虑其与转录因子结合位点、DNase I超敏位点、启动子和增强子的重叠情况。RegulomeDB的评分系统从1a(最可能有调控功能)到7(无证据),帮助研究者从GWAS信号中优先选择功能性变异。该数据库是遗传流行病学和精准医学中非编码变异注释的标准参考工具。

官网与访问

官方网址:https://regulomedb.org/。访问前请确认链接有效,并注意甄别仿冒站点。

分类归属

所属一级分类:肿瘤与疾病基因组学;二级方向:生物标志物工具。资源类型:资源。

主要标签

RegulomeDB调控变异非编码区功能注释ENCODE

主要用途

用于「肿瘤与疾病基因组学 · 生物标志物工具」方向的科研查询、工具调用与资源获取,辅助生物学科研、教学与产业应用。

适用人群

生命科学领域的科研人员、高校师生(本科/硕士/博士)、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。

使用建议

建议优先访问官方网站或机构页面,注意核对域名与版本;对需要账号/权限的资源,优先使用所在机构已采购的数据库权限,并遵守数据使用协议与引用规范。

同类推荐

同属「肿瘤与疾病基因组学 · 生物标志物工具」的其它收录:

小结

RegulomeDB 已纳入生物导航站的「肿瘤与疾病基因组学 · 生物标志物工具」分类,结合上方概述、用途与建议,可帮助你在生物学科研与学习中更快找到权威、可靠的资源入口。

📢特别声明

本站提供的信息都来源于网络,不保证外部链接的准确性和完整性,同时,对于该外部链接的指向,不由本站实际控制,内容如出现违规,可以直接联系网站管理员进行删除。

致力于优质、实用的网络站点资源收集与分享!

本文地址:https://biology.icgrh.com/tool/bio-145398

直达官方网站

点击下方按钮,立即访问 RegulomeDB 的官方站点

访问官网

相关工具 20

P
PharmacoDB
bio-l2-9-3

多数据集癌症药物敏感性统一整合数据库

B
BEST (Biomarker Exploration for Solid Tumors)
bio-l2-9-3

实体瘤综合生物标志物快速探索Web应用

G
GEPIA2
bio-l2-9-3

北大泛癌基因表达交互式分析Web服务器

I
IUPHAR/BPS Guide to Pharmacology
bio-l2-9-3

IUPHAR药理学靶点与配体定量数据库

M
MSK-IMPACT
bio-l2-9-3

MSKCC 505基因癌症临床靶向测序组合

T
TumorPortal
bio-l2-9-4

Broad研究所泛癌显著突变基因与频率门户

O
Oncolytic Virus Database
bio-l2-9-5

溶瘤病毒免疫治疗研究资源数据库

T
TIGER
bio-l2-9-5

肿瘤免疫治疗基因表达与结局数据资源平台

T
TIMEDB
bio-l2-9-1

肿瘤免疫微环境细胞组成综合数据库

T
TIMER2.0
bio-l2-9-1

肿瘤免疫浸润分析Web服务器,多算法整合

F
FoundationOne CDx
bio-l2-9-1

FDA批准广谱癌症伴随诊断NGS检测

M
MuPIT
bio-l2-9-1

癌症体细胞突变蛋白质3D结构映射工具

T
TISCH
bio-l2-9-1

肿瘤微环境单细胞转录组大规模数据库

P
PDGene
bio-l2-9-2

帕金森病遗传关联数据库,GWAS Meta分析参考

Exomiser
Exomiser
bio-l2-9-2

表型驱动外显子组变异排序工具,HPO+频率+功能优先化

PharmGKB
PharmGKB
bio-l2-9-1

Stanford药物基因组学知识库,变异-药物反应临床注释

c
cancerhotspots.org
bio-l2-9-4

MSKCC 3D聚类癌症热点突变数据库

C
Cancer Gene Census
bio-l2-9-4

Sanger研究所致癌基因系统目录

A
AACR Project GENIE
bio-l2-9-4

AACR 100万+肿瘤临床测序基因组学数据共享项目

I
ImmunoCheckDB
bio-l2-9-5

免疫检查点抑制剂生物标志物meta分析平台

💬 用户评论

💬
暂无评论

快来发表第一条评论吧!

🏷️ 标签

RegulomeDB调控变异非编码区功能注释ENCODE