Pegasus

站点概述

Pegasus是由Dana Pe'er实验室（MSKCC/Sloan Kettering）开发的大规模单细胞RNA-seq分析Python工具，专为处理百万级细胞数据设计。Pegasus在算法层面进行了深度优化：利用近似算法和稀疏矩阵运算将分析速度提升10-100倍，支持GPU加速的UMAP/t-SNE降维和Leiden聚类。Pegasus提供了从质控、归一化、高变基因选择、降维、聚类到差异表达和细胞类型注释的完整分析流程。Debias模块提供了高效的批次效应校正。Pegasus与Scanpy生态兼容，支持AnnData格式和H5AD文件，也提供了交互式可视化界面Pegasus Web。

官网与访问

官方网址：https://pegasus.readthedocs.io/。访问前请确认链接有效，并注意甄别仿冒站点。

分类归属

所属一级分类：学习资源与社区；二级方向：开源项目与GitHub仓库。资源类型：资源。

主要标签

单细胞分析、大规模分析、GPU加速、批处理、Python

主要用途

用于「学习资源与社区 · 开源项目与GitHub仓库」方向的科研查询、工具调用与资源获取，辅助生物学科研、教学与产业应用。

适用人群

生命科学领域的科研人员、高校师生（本科/硕士/博士）、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。

使用建议

建议优先访问官方网站或机构页面，注意核对域名与版本；对需要账号/权限的资源，优先使用所在机构已采购的数据库权限，并遵守数据使用协议与引用规范。

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小结

Pegasus 已纳入生物导航站的「学习资源与社区 · 开源项目与GitHub仓库」分类，结合上方概述、用途与建议，可帮助你在生物学科研与学习中更快找到权威、可靠的资源入口。