💡 AIRR Data Commons 是什么?
站点概述
AIRR(Adaptive Immune Receptor Repertoire)Data Commons是由AIRR Community建立的开放源码免疫受体测序数据共享平台。该平台整合了多个独立数据库(包括iRepertoire和VDJ Server等),拥有超过54亿条序列注释,是当前最大的免疫细胞受体序列数据库。AIRR Community制定了AIRR-seq数据的采集、存储、提交、注释和共享的标准规范(MiAIRR),以及统一的数据文件格式(AIRR TSV和Rearrangement TSV),为免疫组库研究建立了标准化的数据分析环境。iReceptor科学网关提供了跨数据库的联合查询和分析功能,支持基于AIRR标准的分布式数据发现与探索。
官网与访问
官方网址:https://airr-community.org/。访问前请确认链接有效,并注意甄别仿冒站点。
分类归属
所属一级分类:数据库与数据资源;二级方向:开源项目与GitHub仓库。资源类型:资源。
主要标签
免疫组库、AIRR标准、适应性免疫、数据共享、BCR/TCR
主要用途
用于「数据库与数据资源 · 开源项目与GitHub仓库」方向的科研查询、工具调用与资源获取,辅助生物学科研、教学与产业应用。
适用人群
生命科学领域的科研人员、高校师生(本科/硕士/博士)、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。
使用建议
建议优先访问官方网站或机构页面,注意核对域名与版本;对需要账号/权限的资源,优先使用所在机构已采购的数据库权限,并遵守数据使用协议与引用规范。
同类推荐
同属「数据库与数据资源 · 开源项目与GitHub仓库」的其它收录:
小结
AIRR Data Commons 已纳入生物导航站的「数据库与数据资源 · 开源项目与GitHub仓库」分类,结合上方概述、用途与建议,可帮助你在生物学科研与学习中更快找到权威、可靠的资源入口。
本站提供的信息都来源于网络,不保证外部链接的准确性和完整性,同时,对于该外部链接的指向,不由本站实际控制,内容如出现违规,可以直接联系网站管理员进行删除。
致力于优质、实用的网络站点资源收集与分享!
点击下方按钮,立即访问 AIRR Data Commons 的官方站点
⚡ 相关工具 20
TCGA肿瘤免疫组学数据库,含TCR/BCR/新抗原/TIL数据
Broad Institute大规模基因组分析框架,基于Spark,UKB GWAS基础设施
R交互式流式细胞术分析包,开源免费的FlowJo替代方案
Sanger研究所自动细胞类型注释工具,100+免疫细胞亚型模型
Ensembl变异功能注释工具,最广泛使用的变异注释软件
Theis Lab单细胞动力学工具,马尔可夫链模型预测细胞命运
Baker Lab全原子版RFdiffusion,支持侧链级精确蛋白质设计
开源多组学机器学习平台,交互式生物标志物发现工具
Intel/Broad高性能基因组变异存储系统,GATK4默认gVCF合并后端
深势科技开源国产AlphaFold2复现,支持华为昇腾平台
10x Genomics空间转录组分析软件,Visium/Visium HD全流程
Babraham NGS自动预处理工具,Cutadapt+FastQC封装器
NIH k-mer组装质量评估工具,参考无关QV/完整性/错误率计算
国际人类表观基因组联盟,整合多国参考表观基因组数据
最广泛使用的开源分子动力学模拟软件,GPU加速高性能计算
Broad Institute单细胞数据共享和可视化门户,HCA数据门户
犹他大学evidence-based基因组注释流程,整合多来源基因预测
密歇根大学蛋白质组学分析管道,MSFragger搜索引擎提速100倍
NIH综合脂质组学资源,47000+脂质结构和八大类分类系统
UCSF免费化合物数据库,含数亿可购买分子用于虚拟筛选
💬 用户评论
快来发表第一条评论吧!