💡 VDJdb 是什么?

站点概述

VDJdb是一个将T细胞受体(TCR)序列与其pMHC配体唯一关联的数据库,发表于2018年Nucleic Acids Research。与仅关注病理条件的McPAS-TCR不同,VDJdb不限制收集TCR-pMHC配对的生物学背景,涵盖了更广泛的TCR-抗原相互作用信息。VDJdb通过社区贡献和文献挖掘持续更新,每条记录包含CDR3序列、V/J基因、表位、MHC限制性和来源物种等详细信息。该数据库是TCR特异性研究、TCR交叉反应性分析和TCR工程化改造的重要参考资源。VDJdb的数据可通过网页浏览和API接口获取,也可从GitHub下载完整数据集。

官网与访问

官方网址:https://vdjdb.cdr3.net/。访问前请确认链接有效,并注意甄别仿冒站点。

分类归属

所属一级分类:数据库与数据资源;二级方向:开源项目与GitHub仓库。资源类型:资源。

主要标签

TCR数据库、抗原特异性、免疫受体、MHC、T细胞

主要用途

用于「数据库与数据资源 · 开源项目与GitHub仓库」方向的科研查询、工具调用与资源获取,辅助生物学科研、教学与产业应用。

适用人群

生命科学领域的科研人员、高校师生(本科/硕士/博士)、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。

使用建议

建议优先访问官方网站或机构页面,注意核对域名与版本;对需要账号/权限的资源,优先使用所在机构已采购的数据库权限,并遵守数据使用协议与引用规范。

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小结

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