📁免疫学与抗体工程 / 抗体设计与表位预测（21 个工具）
C
CEDAR
bio-l2-11-2
IEDB癌症表位数据库，肿瘤抗原T/B细胞表位参考
O
OAS
bio-l2-11-2
Oxford大规模抗体序列数据库，20亿+抗体序列统计查询
C
Chai-2
bio-l2-11-2
Chai Discovery AI抗体-抗原对接工具，扩散模型复合物预测
DiscoTope
bio-l2-11-2
DTU构象B细胞表位预测工具，3D结构不连续表位识别
BepiPred
bio-l2-11-2
DTU B细胞线性表位预测工具，随机森林序列特征分析
NetMHCIIpan
bio-l2-11-2
DTU MHC-II结合预测工具，HLA-DR/DP/DQ辅助T细胞表位
NetMHCpan
bio-l2-11-2
DTU泛MHC-I结合预测工具，12,000+等位基因肽段亲和力
E
EpiPred
bio-l2-11-2
Oxford抗原表位预测工具，3D结构构象表位映射
AbPredict
bio-l2-11-2
Rosetta抗体序列设计工具，逆折叠优化抗体稳定性
P
Parapred
bio-l2-11-2
Oxford抗体副位点预测工具，序列层面结合残基识别
N
NanoBodyBuilder2
bio-l2-11-2
Oxford纳米抗体VHH建模工具，深度学习单域抗体结构预测
A
ABangle
bio-l2-11-2
Oxford抗体VH-VL取向分析工具，6参数几何特征量化
T
TAP
bio-l2-11-2
Oxford治疗性抗体可开发性评估，7指标成药性筛选
A
Ab-Ligity
bio-l2-11-2
Oxford抗体相似性评分工具，CDR序列聚类与功能分类
DeepAb
bio-l2-11-2
深度学习+Rosetta抗体预测，神经网络约束CDR H3优化
RosettaAntibody
bio-l2-11-2
Rosetta抗体建模服务器，蒙特卡洛CDR H3 de novo折叠
ImmuneBuilder
bio-l2-11-2
Oxford深度学习免疫蛋白建模，抗体/NanoBody/TCR结构预测
IgFold
bio-l2-11-2
Johns Hopkins深度学习抗体预测，图神经网络CDR H3建模
A
ABodyBuilder2
bio-l2-11-2
Oxford抗体同源建模工具，CDR H3环优化结构预测
S
SAbDab
bio-l2-11-2
Oxford抗体结构数据库，PDB抗体CDR定义与界面注释
I
IEDB
bio-l2-11-2
全球最全免疫表位数据库，MHC/B/T细胞表位预测与查询