📁免疫学与抗体工程 / 免疫组库分析（25 个工具）

Stanford免疫反卷积工具，22种免疫细胞丰度估算

转录组免疫细胞丰度评估，T细胞亚群定量

IgSimulator

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USC免疫组库仿真工具，基准测试仿真数据生成

VDJ在线注释工具，IMGT标准命名快速TCR/BCR注释

CATT

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R语言克隆型分析与追踪工具，肿瘤免疫组库比较

R语言TCR分析包，多样性与克隆共享探索性分析

临床免疫组库MRD监测产品，CLIA认证血液肿瘤克隆检测

Adaptive免疫组库商业平台，100亿+TCR序列最大数据库

shazam

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Immcantation选择压力分析R包，正/负选择强度量化

TIgGER

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Immcantation基因分型推断R包，新等位基因发现

pRESTO

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Immcantation预处理模块，UMI提取与配对组装质控

Change-O

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Immcantation克隆型鉴定模块，体细胞突变分组克隆定义

Alakazam

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Immcantation抗体进化分析R包，体细胞超突变与克隆树

Platypus

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单细胞多组学免疫分析R包，scRNA+TCR/BCR+CITE-seq整合

VDJserver

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UT Southwestern免疫组库在线分析平台，云端VDJ全流程

R语言免疫组库分析包，多格式统一接口快速分析

scRepertoire

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Bioconductor单细胞免疫组库R包，TCR/BCR+scRNA-Seq整合

ImmunediveRsity

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R语言免疫组库多样性分析包，Hill数与克隆型分布可视化

免疫组库组装错误校正工具，UMI精确量化克隆型丰度

IgBLAST

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NCBI免疫球蛋白BLAST工具，Germline VDJ注释基础引擎

TRUST4

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Dana-Farber RNA-Seq免疫组库提取工具，无需专用文库

VDJtools

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免疫组库后处理框架，多样性/重叠/频率统计可视化

免疫组库R分析框架，pRESTO+Change-O+TIgGER全流程

IMGT/HighV-QUEST

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IMGT大规模免疫组库注释工具，V-D-J标准化命名权威

高性能免疫组库分析工具，VDJ提取与克隆型定量标准