CrossMap

站点概述

CrossMap是Python编写的基因组坐标转换（LiftOver）工具，将BED、GFF、VCF、SAM/BAM和Wig等文件中的基因组坐标从一个参考版本转换到另一个版本（如hg19→hg38）。底层使用UCSC LiftOver chain文件，支持批量转换和多格式输入。是参考基因组版本升级和跨版本数据比较的必备工具。

官网与访问

官方网址：http://crossmap.sourceforge.net/。访问前请确认链接有效，并注意甄别仿冒站点。

分类归属

所属一级分类：学习资源与社区；二级方向：通用数据格式转换。资源类型：资源。

主要标签

基因组坐标转换、LiftOver、参考版本、命令行

主要用途

用于「学习资源与社区 · 通用数据格式转换」方向的科研查询、工具调用与资源获取，辅助生物学科研、教学与产业应用。

适用人群

生命科学领域的科研人员、高校师生（本科/硕士/博士）、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。

使用建议

建议优先访问官方网站或机构页面，注意核对域名与版本；对需要账号/权限的资源，优先使用所在机构已采购的数据库权限，并遵守数据使用协议与引用规范。

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小结

CrossMap 已纳入生物导航站的「学习资源与社区 · 通用数据格式转换」分类，结合上方概述、用途与建议，可帮助你在生物学科研与学习中更快找到权威、可靠的资源入口。