💡 GEO 是什么?

站点概述

GEO(Gene Expression Omnibus)是NCBI维护的基因表达综合数据库,收录微阵列、RNA-Seq和高通量测序等功能基因组学数据。存储超过450万个人类样本的数据,支持GEO2R在线差异表达分析和GEOquery R包批量数据获取。是基因表达数据挖掘和再分析最重要的公共资源,研究者经常利用GEO数据验证自己的发现或进行meta分析。

官网与访问

官方网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/。访问前请确认链接有效,并注意甄别仿冒站点。

分类归属

所属一级分类:生物信息学;二级方向:数据库与数据检索。资源类型:资源。

主要标签

基因表达、功能基因组、微阵列、数据挖掘

主要用途

用于「生物信息学 · 数据库与数据检索」方向的科研查询、工具调用与资源获取,辅助生物学科研、教学与产业应用。

适用人群

生命科学领域的科研人员、高校师生(本科/硕士/博士)、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。

使用建议

建议优先访问官方网站或机构页面,注意核对域名与版本;对需要账号/权限的资源,优先使用所在机构已采购的数据库权限,并遵守数据使用协议与引用规范。

同类推荐

同属「生物信息学 · 数据库与数据检索」的其它收录:

小结

GEO 已纳入生物导航站的「生物信息学 · 数据库与数据检索」分类,结合上方概述、用途与建议,可帮助你在生物学科研与学习中更快找到权威、可靠的资源入口。

📢特别声明

本站提供的信息都来源于网络,不保证外部链接的准确性和完整性,同时,对于该外部链接的指向,不由本站实际控制,内容如出现违规,可以直接联系网站管理员进行删除。

致力于优质、实用的网络站点资源收集与分享!

本文地址:https://biology.icgrh.com/tool/bio-143956

直达官方网站

点击下方按钮,立即访问 GEO 的官方站点

访问官网

⚡ 相关工具 20

dbGaP
dbGaP
生物信息学

NCBI基因型-表型数据库,GWAS受控数据访问平台

G
GOLD
生物信息学

基因组在线数据库,追踪全球基因组测序计划与项目元数据

EGA
EGA
生物信息学

欧洲基因组-表型档案库,受控访问的人类遗传数据共享

UCSC Genome Browser
UCSC Genome Browser
生物信息学

UCSC基因组浏览器,丰富注释轨道的基因组可视化平台

D
DDBJ
生物信息学

日本DNA数据库,INSDC三大成员之一

BioSample
BioSample
生物信息学

NCBI生物样本描述数据库,标准化的样本元数据管理

EBI BioSamples
EBI BioSamples
生物信息学

EBI生物样本元数据库,统一管理跨数据库的样本描述信息

R
RNAcentral
生物信息学

非编码RNA综合数据库,整合50+专业RNA数据库

dbSNP
dbSNP
生物信息学

NCBI遗传变异数据库,全球最全的SNP与多态性参考

ArrayExpress
ArrayExpress
生物信息学

EBI基因表达数据库,微阵列与RNA-Seq功能基因组学数据

E
ExAC
生物信息学

外显子组聚合数据库,60,706人外显子组变异频率参考

B
BioXFinder
生物信息学

国产综合性生物信息数据库,整合蛋白质结构与分子数据

UniProt
UniProt
生物信息学

全球最权威的蛋白质序列与功能注释数据库

EBI Search
EBI Search
生物信息学

EBI统一跨库搜索服务,数十数据库一站式检索

ENA
ENA
生物信息学

欧洲核酸档案,INSDC三大成员之一

Pfam
Pfam
生物信息学

蛋白质家族HMM数据库,2万+家族的结构域分类与注释

ClinVar
ClinVar
生物信息学

NCBI临床变异评估数据库,变异致病性分类的权威参考

CNGBdb
CNGBdb
生物信息学

中国国家基因库数据库,整合多组学数据存储与共享平台

g
gnomAD
生物信息学

基因组聚合数据库,全球最大人群等位基因频率资源

BioProject
BioProject
生物信息学

NCBI生物项目数据库,整合关联大规模测序研究的数据

💬 用户评论

💬
暂无评论

快来发表第一条评论吧!

🏷️ 标签

基因表达功能基因组微阵列数据挖掘