📁肿瘤与疾病基因组学 / 癌症数据挖掘（32 个工具）

癌症体细胞突变蛋白质3D结构映射工具

FDA批准广谱癌症伴随诊断NGS检测

NCI肿瘤临床蛋白质组学联盟，泛癌多组学数据

肽-HLA复合物结构建模与分析环境

肿瘤微环境单细胞药物响应与耐药数据库

肿瘤免疫浸润分析Web服务器，多算法整合

肿瘤微环境单细胞转录组大规模数据库

肿瘤免疫微环境细胞组成综合数据库

NCI癌症影像公共数据库，影像基因组学首选

癌症生存分析在线工具，基因签名预后价值评估

文献挖掘癌症基因知识库，NLP提取基因-药物关联

泛癌症全基因组分析项目，2,600+癌症WGS里程碑数据

Sanger癌症药物敏感性基因组学，1,000药×1,000细胞系

Broad癌症依赖图谱平台，CRISPR全基因组筛选靶点发现

Broad癌细胞系百科全书，1,800+细胞系组学与药敏数据

Sanger突变签名分析平台，SBS/DBS/Indel病因分解

IntOGen

bio-l2-9-1

7方法整合癌症驱动基因发现平台，泛癌症驱动图谱

dNdScv

bio-l2-9-1

Sanger dN/dS选择压力分析工具，癌症正向选择基因检测

OncodriveFML

bio-l2-9-1

功能水平癌症驱动突变检测工具，非编码驱动元件发现

MutSigCV

bio-l2-9-1

Broad癌症显著突变基因检测工具，驱动基因统计鉴定

Broad拷贝数显著区域检测工具，癌症驱动CNV鉴定

OncoGEMINI

bio-l2-9-1

肿瘤内异质性分析工具，多区域测序克隆进化推断

maftools

bio-l2-9-1

MSKCC MAF文件处理R包，TCGA突变oncoplot标准工具

MutScape

bio-l2-9-1

癌症体细胞突变可视化R包，MAF文件统计分析与瀑布图

NCI癌细胞系数据分析工具，NCI-60组学与药敏关联

PharmGKB

bio-l2-9-1

Stanford药物基因组学知识库，变异-药物反应临床注释

CIViC

bio-l2-9-1

社区驱动癌症变异临床知识库，开放审校变异-药物证据

OncoKB

bio-l2-9-1

MSKCC精准肿瘤学知识库，变异-药物临床证据分级注释

UCSC癌症多组学可视化分析平台，TCGA/GTEx在线探索

COSMIC

bio-l2-9-1

Sanger癌症体细胞突变目录，1,500万+体细胞变异注释