📁植物与农业基因组 / 植物分析工具(26 个工具)
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RiceGAAS
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水稻基因组自动化注释与功能预测系统
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BreedBase
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基于BrAPI标准的育种数据管理与试验设计平台
Flapjack
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植物育种基因型与表型数据可视化软件
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GAPIT
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R语言GWAS关联分析与基因组预测集成包
T
TASSEL
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经典植物GWAS关联分析与混合线性模型软件
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Plant DNA C-values
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植物基因组大小C值数据库
I
IWGSC
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国际小麦基因组测序联盟参考基因组资源
Panzea
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玉米泛基因组与遗传变异数据库
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PhenoFront
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高通量植物表型数据管理与分析平台
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WheatRegNet
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小麦基因调控网络与共表达数据库
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PlantRegulomics
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植物调控组学多组学整合分析平台
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植物转录因子与结合位点综合数据库
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Planteome
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植物本体论与性状注释平台
PlantCV
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开源高通量植物表型图像分析Python工具
G
GreenPhylDB
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植物基因家族聚类与比较基因组数据库
MAKER
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多证据整合真核基因组注释流程
B
BRAKER2
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自动化真核基因组基因预测与注释流程
CyVerse
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植物科学计算基础设施与云平台
T
TropGeneDB
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热带作物基因组遗传与表型数据库
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BioMart
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多数据库统一批量查询与数据挖掘接口
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Germinate
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开源植物遗传资源数据管理平台
P
PlnTFDB
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植物转录因子与转录调控因子数据库
N
New PLACE
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植物顺式作用调控DNA元件数据库
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Plant Reactome
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植物生物途径与反应注释数据库
M
MetaCrop
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手动注释的主要作物代谢途径数据库
C
CoGe
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植物比较基因组学与共线性在线平台