💡 codeml 是什么?
站点概述
codeml是进化与系统发育领域系统发育构建方向的专业工具,提供密码子模型、选择压力、dN/dS等系统发育树构建与分析的专业功能。支持基于多序列比对数据的多种建树方法,包括最大似然法(ML)、贝叶斯推断法(BI)、邻接法(NJ)、最大简约法(MP)等,并提供替换模型选择、自展支持率评估和树拓扑检验等树质量评估工具。适用于分子系统学、物种界定、生物地理学和宏进化研究等多种场景,可处理从几十到上千条序列的数据集。该工具免费提供使用,是进化生物学研究中最常引用的系统发育分析软件之一。
官网与访问
官方网址:http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html。访问前请确认链接有效,并注意甄别仿冒站点。
分类归属
所属一级分类:进化与系统发育;二级方向:系统发育构建。资源类型:资源。
主要标签
密码子模型、选择压力、dN/dS
主要用途
用于「进化与系统发育 · 系统发育构建」方向的科研查询、工具调用与资源获取,辅助生物学科研、教学与产业应用。
适用人群
生命科学领域的科研人员、高校师生(本科/硕士/博士)、生物信息分析师、医药与农业研发人员、以及生物爱好者与科普创作者。
使用建议
建议优先访问官方网站或机构页面,注意核对域名与版本;对需要账号/权限的资源,优先使用所在机构已采购的数据库权限,并遵守数据使用协议与引用规范。
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小结
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